Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH02

Tor4a, Torsin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor4aQ8BH02 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tor4aQ8BH02 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tor4aQ8BH02 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms