Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGZ1

Hpcal4, Hippocalcin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal4Q8BGZ1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hpcal4Q8BGZ1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hpcal4Q8BGZ1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms