Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms