Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q8BGC1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q8BGC1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms