Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Htatsf1Q8BGC0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htatsf1Q8BGC0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms