Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc172Q810N9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc172Q810N9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms