Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ChfrQ810L3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms