Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ttc28Q80XJ3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ttc28Q80XJ3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ttc28Q80XJ3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ttc28Q80XJ3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc28Q80XJ3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Ttc28Q80XJ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ttc28Q80XJ3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ttc28Q80XJ3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ttc28Q80XJ3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ttc28Q80XJ3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ttc28Q80XJ3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Ttc28Q80XJ3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ttc28Q80XJ3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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