Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chn2Q80XD1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms