Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Zbed4Q80WQ9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Zbed4Q80WQ9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms