Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcsk9Q80W65 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms