Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rexo1Q7TT28 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Rexo1Q7TT28 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rexo1Q7TT28 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms