Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSV6

Got1l1, Putative aspartate aminotransferase, cytoplasmic 2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1l1Q7TSV6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Got1l1Q7TSV6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Got1l1Q7TSV6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms