Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kcnf1Q7TSH7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kcnf1Q7TSH7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms