Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Dsg1bQ7TSF1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Dsg1bQ7TSF1 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms