Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf139Q7TMV1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf139Q7TMV1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms