Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Abcg2Q7TMS5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms