Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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