Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Ubfd1Q78JW9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ubfd1Q78JW9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ubfd1Q78JW9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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