Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cspg5Q71M36 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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