Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynmQ70IV5 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms