Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cnih3Q6ZWS4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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