Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RfflQ6ZQM0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfflQ6ZQM0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RfflQ6ZQM0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RfflQ6ZQM0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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