Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ncapd3Q6ZQK0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ncapd3Q6ZQK0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms