Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Kcnt1Q6ZPR4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Kcnt1Q6ZPR4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kcnt1Q6ZPR4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Kcnt1Q6ZPR4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Kcnt1Q6ZPR4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnt1Q6ZPR4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms