Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc88cQ6VGS5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms