Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc154Q6RUT8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc154Q6RUT8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms