Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PdgfrlQ6PE55 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PdgfrlQ6PE55 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms