Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zbtb40Q6PCS8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zbtb40Q6PCS8 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms