Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y5

Znf280c, Zinc finger protein 280C, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280cQ6P3Y5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Znf280cQ6P3Y5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Znf280cQ6P3Y5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf280cQ6P3Y5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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