Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hdac10Q6P3E7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms