Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mvb12bQ6KAU4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms