Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tpm4Q6IRU2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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