Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp11bQ6DFW5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp11bQ6DFW5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms