Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q6DFW0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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