Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rftn1Q6A0D4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms