Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cep290Q6A078 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cep290Q6A078 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cep290Q6A078 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cep290Q6A078 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cep290Q6A078 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cep290Q6A078 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cep290Q6A078 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cep290Q6A078 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cep290Q6A078 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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