Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Msl2Q69ZF8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms