Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtprdQ64487 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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PtprdQ64487 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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