Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Surf4Q64310 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms