Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ly6eQ64253 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ly6eQ64253 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.2 ms