Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pan3Q640Q5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms