Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Vat1Q62465 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Vat1Q62465 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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