Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nptx1Q62443 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms