Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tpd52Q62393 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tpd52Q62393 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms