Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SnrpaQ62189 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SnrpaQ62189 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms