Protein–RNA interactions for Protein: Q61735

Cd47, Leukocyte surface antigen CD47, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd47Q61735 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cd47Q61735 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Cd47Q61735 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cd47Q61735 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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