Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg1aQ61495 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms