Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PcolceQ61398 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PcolceQ61398 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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