Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsg101Q61187 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms